Fauna

        Fauna terestră este reprezentată de un număr de  313 taxoni, 29 endemisme, 45 specii rare, din care 119 specii protejate şi strict protejate de legislaţia română şi internaţională.

         Fauna cavernicolă cuprinde 273 specii şi subspecii de nevertebrate.

       Nevertebratele includ un număr mare de specii cu areal restrâns. Pe suprafaţa Parcului au fost semnalate un număr de 40 specii de gasteropode din care 14 specii endemice şi 4 specii rare. Zoocenoza de moluşte prozobranchiate a Nerei reprezintă o raritate pe plan mondial, printre speciile acesteia merită amintite: Amphimelaria hollandri, Fagotia esperi, Fagotia acicularis, Theodoxus danubialis. Alte specii de nevertebrate incluse printre speciile endemice sunt: Carpatica langi, Odontopodisma montana, Sago pedo, etc.

  Ihtiofauna Nerei a fost evaluată la 28 de specii dintre care importante pentru conservare sunt: Cobitis elongata – fâsa mare, relict terţiar şi Aspro streber – fusar.

  Herpetofauna este reprezentată atât de specii de amfibieni cât şi de reptile protejate de legislaţia naţională şi internaţională. Printre speciile de amfibieni se pot aminti: Rana ridibunda, Rana dalmatia, Triturus cristatus, Triturus alpestris.  Reptilele sunt reprezentate de specii precum: Vipera ammodytes ammodytes, Lacerta viridis, Lacerta agilis, Lacerta muralis, dar şi relicte glaciare precum Vipera berus şi Lacerta vivipara.

  Avifauna include de asemenea specii protejate precum: Bubo bubo, Tyto alba, Hirudo rupestris, Apus melba, Oenanthe hispanica, Hirudo daurica, Emberiza cia.

  Mamiferele  sunt reprezentate de specii precum Ursus arctos, Canis lupus, Lynx lynx sau Felix silvestris. Aceste specii se regăsesc în Cartea Roşie a Vertebratelor din România.